RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP11Q86VZ4 500 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX18Q8N8Q8 333 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRLF2Q9HC73 371 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP26Q9NRE1 261 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1RLQ9NZP8 487 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF114Q9Y508 228 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AUP1Q9Y679 476 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A096LPK6 155 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BNH8 94 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NGFP01138 241 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSNP06396 782 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSF1P09603 554 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNA2P20248 432 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RETREG3Q86VR2 466 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGCDQ92629 289 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APIPQ96GX9 242 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAL3ST1Q99999 423 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRF2Q9HAW0 419 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOX3Q9HBY0 568 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP13Q9UII6 198 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX6Q9UNH7 406 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISPDA4D126 451 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC36A6NLP5 189 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIP5K1CO60331 668 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV1-44P01699 117 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALOX5P09917 674 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDCP20711 480 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASMTP46597 345 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTNR1AP48039 350 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB4P48594 390 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC16A1P53985 500 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL4CP56559 192 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SESN3P58005 492 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL8P80075 99 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBFBQ13951 182 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REP15Q6BDI9 236 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC73Q6P1J9 531 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AAED1Q7RTV5 226 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5W2Q8NH69 310 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC39Q96DD0 335 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPNE1Q99829 537 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH7Q9H992 704 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCTPQ9UKL6 214 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TENM2Q9NT68 2774 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPW3 197 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV3-15P01624 115 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1C1P21283 382 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSTR1P30872 391 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K8P41279 467 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPZA2P47755 286 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDH13P55290 713 aa8.67□□□□□ -1.02
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