RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	MXRA7	P84157	204 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	DMTN	Q08495	405 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TREML1	Q86YW5	311 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	PIGX	Q8TBF5	258 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	PROX1	Q92786	737 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	C3orf49	Q96BT1	292 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ARL5B	Q96KC2	179 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM2	Q9C040	744 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	JKAMP	Q9P055	326 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059		A8MVM7	634 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059		A8MXE2	369 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	DNPH1	O43598	174 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	AHSA1	O95433	338 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	GPI	P06744	558 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CD8B	P10966	210 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SLC7A2	P52569	658 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SLC35A1	P78382	337 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SORD	Q00796	357 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	BNIP2	Q12982	314 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	VEZF1	Q14119	521 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	OR7A5	Q15622	319 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ADAM19	Q9H013	955 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CYTIP	O60759	359 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	C8B	P07358	591 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	YES1	P07947	543 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	PNMT	P11086	282 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	IGFBP2	P18065	325 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	FPR1	P21462	350 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TLE4	Q04727	773 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM7	Q14002	265 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	MICU2	Q8IYU8	434 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF583	Q96ND8	569 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	MCHR1	Q99705	422 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	GP6	Q9HCN6	339 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	BAG5	Q9UL15	447 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GWA3	101 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	GMNN	O75496	209 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	LGI1	O95970	557 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	FAM107A	O95990	144 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	CD247	P20963	164 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	CD79B	P40259	229 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	GZMM	P51124	257 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	LIPE	Q05469	1076 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	GUSBP1	Q15486	140 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	OR1Q1	Q15612	314 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	DUSP7	Q16829	419 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	ULK3	Q6PHR2	472 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC80	Q76M96	950 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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