RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	IDS	B3KWA1	339 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	DCTN6	O00399	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	SUPT7L	O94864	414 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	LGI1	O95970	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC130	P13994	396 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	HTR1F	P30939	366 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CALCR	P30988	508 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CAV2	P51636	162 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	TIMM10	P62072	90 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	TLE4	Q04727	773 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309		Q8N7P7	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	VCX2	Q9H322	139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ASB8	Q9H765	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ABCD4	O14678	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PCMT1	P22061	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	RFC4	P35249	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	FGL1	Q08830	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PSG7	Q13046	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	GRB7	Q14451	532 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309		H0Y9J4	135 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	HIP1	O00291	1037 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PRKAB2	O43741	272 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	CD1B	P29016	333 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	DRD3	P35462	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PKNOX1	P55347	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	UBE2H	P62256	183 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	IL24	Q13007	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	CHIT1	Q13231	466 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309		V9GY05	133 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	UGT1A9	O60656	530 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	DIRAS1	O95057	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	STAMBP	O95630	424 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	POU2F1	P14859	743 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	NPR2	P20594	1047 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	COX7A1	P24310	79 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	GNA11	P29992	359 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	SHMT2	P34897	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ASPH	Q12797	758 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	KLRB1	Q12918	225 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CASP4-208	ENST00000530309	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms