RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDC20Q12834 499 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 IL15RAQ13261 267 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM159AQ6UWV7 190 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM92BQ6ZTR7 304 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 LANCL3Q6ZV70 420 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 VPS36Q86VN1 386 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 VSIG1Q86XK7 387 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RDH10Q8IZV5 341 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYT14Q8NB59 555 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR4F15Q8NGB8 312 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR9G1Q8NH87 305 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF5Q99942 180 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLMPQ9H6B4 373 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 VCPKMTQ9H867 229 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 BCAP29Q9UHQ4 241 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 TENM3Q9P273 2699 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 PTPRTO14522 1441 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SEC16AO15027 2179 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 PEX7O00628 323 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF263O14978 683 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 AGPAT2O15120 278 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RBMY1CP0DJD4 496 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CXCR2P25025 360 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 BTCP35070 178 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC26A3P40879 764 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ESRRGP62508 458 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 REG3AQ06141 175 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SCYL2Q6P3W7 929 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM270Q6UE05 265 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF410Q86VK4 478 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 PAQR7Q86WK9 346 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR8H3Q8N146 312 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF664Q8N3J9 261 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 LPCAT1Q8NF37 534 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAHD2AQ96GK7 314 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FTHL17Q9BXU8 183 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SIRPDQ9H106 197 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 HOMER3Q9NSC5 361 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNRD1Q9P1U0 126 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF222A6NCQ9 220 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM74A7A6NL05 159 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 WASHC1A8K0Z3 465 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADAM12O43184 909 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLUP10909 449 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ANXA3P12429 323 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATP6V1B2P21281 511 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 BDKRB1P46663 353 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIAA1024LP59773 190 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 MYBPC1Q00872 1141 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 BAMBIQ13145 260 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIAA0087Q14695 138 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLMAPQ14BN4 828 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADPRMQ3LIE5 342 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SMARCD3Q6STE5 483 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 C15orf54Q8N8G6 183 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 STKLD1Q8NE28 680 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CNIH3Q8TBE1 160 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CD300LFQ8TDQ1 290 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF139Q8WU17 664 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 DTD2Q96FN9 168 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SDSLQ96GA7 329 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF385DQ9H6B1 395 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 C1orf123Q9NWV4 160 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCYOX1Q9UHG3 505 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 SIGLEC9Q9Y336 463 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC7Q96M83 1385 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSTT2P0CG29 244 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSTT2BP0CG30 244 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 CYP2B6P20813 491 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 DPP4P27487 766 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 FMO3P31513 532 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 NTHL1P78549 312 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF616Q08AN1 781 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 GUCA2BQ16661 112 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 VAX1Q5SQQ9 334 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 GPRC6AQ5T6X5 926 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-988P-201ENST00000519081 ACTRT1Q8TDG2 376 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms