RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 CYB561P49447 251 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF84P51523 738 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NUP107P57740 925 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 VAMP2P63027 116 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HBA1P69905 142 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PHEXP78562 749 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TGM3Q08188 693 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KLF10Q13118 480 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SERTAD2Q14140 314 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SELPLGQ14242 412 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAPK14Q16539 360 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NTRK2Q16620 822 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 IMPG1Q17R60 797 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SPIN4Q56A73 249 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 LGSNQ5TDP6 509 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ARSKQ6UWY0 536 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RTL4Q6ZR62 310 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MARCH3Q86UD3 253 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 LCA5Q86VQ0 697 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMEM156Q8N614 296 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 BCORP1Q8N888 145 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NUBPLQ8TB37 319 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF675Q8TD23 568 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NRGNQ92686 78 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAB8BQ92930 207 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 VPS33AQ96AX1 596 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZG16BQ96DA0 208 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ELP4Q96EB1 424 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 C5orf34Q96MH7 638 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 BTBD9Q96Q07 612 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TIMP4Q99727 224 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC77Q9BR77 488 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 UCK2Q9BZX2 261 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 UBQLN3Q9H347 655 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 REEP4Q9H6H4 257 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 AIG1Q9NVV5 245 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HPF1Q9NWY4 346 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HSF4Q9ULV5 492 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NF1P21359 2839 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 A0A1W2PPR1 153 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FRG2CA6NGY1 282 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMEM114B3SHH9 223 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 E9PBE3 544 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 H7C1Q1 480 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC28A1O00337 649 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCL21O00585 134 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 AP3D1O14617 1153 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLOD3O60568 738 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KLHL41O60662 606 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FZD7O75084 574 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 JTBO76095 146 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms