RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 APBB3O95704 486 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNA6P05013 189 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SYPP08247 313 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SBK2P0C263 348 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ST6GAL1P15907 406 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CTHP32929 405 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1CAP62136 330 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAM8P78325 824 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TFF2Q03403 129 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GPAT4Q86UL3 456 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR51J1Q9H342 316 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM4BO94953 1096 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LIPCP11150 499 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GTF2F2P13984 249 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GMFBP60983 142 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TPBGQ13641 420 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ULK3Q6PHR2 472 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM8Q8N371 416 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 EXO5Q9H790 373 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 HTTP42858 3142 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NPIPB8E9PQR5 432 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PROS1P07225 676 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 VAMP1P23763 118 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TPMTP51580 245 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 POU4F3Q15319 338 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 COMTD1Q86VU5 262 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NOX4Q9NPH5 578 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TSC2P49815 1807 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PI62 339 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNJ13O60928 360 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 RBBP9O75884 186 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PTHLHP12272 177 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GP1BBP13224 206 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PTH2RP49190 550 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 RDH10Q8IZV5 341 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 COQ8AQ8NI60 647 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf72A6NCS6 295 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R233 179 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DPM1O60762 260 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SEMG1P04279 462 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 EVX1P49640 407 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 C21orf58P58505 322 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SIRPAP78324 504 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK5Q00535 292 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR176Q14439 515 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 HBMQ6B0K9 141 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SIAH3Q8IW03 269 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5J2Q8NH18 312 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP76Q8TAP6 659 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DIO2Q92813 273 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 HYLS1Q96M11 299 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CMKLR1Q99788 373 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NT5DC2Q9H857 520 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ASB6Q9NWX5 421 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CA14Q9ULX7 337 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SDK2Q58EX2 2172 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 AK1P00568 194 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTA2P62736 377 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTG2P63267 376 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 COX14Q96I36 57 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 S100A13Q99584 98 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PPM1BO75688 479 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ARPC4P59998 168 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FAPQ12884 760 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK10Q15131 360 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms