RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UGT2B10P36537 528 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD79BP40259 229 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DIO1P49895 249 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC7A2P52569 658 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC25A3Q00325 362 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDK6Q00534 326 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPS8Q12929 822 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FXNQ16595 210 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SYT14P1Q58G82 188 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GRINAQ7Z429 371 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LURAP1LQ8IV03 231 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TUSC5Q8IXB3 177 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CADM2Q8N3J6 435 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARL5BQ96KC2 179 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1orf21Q9H246 121 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RASSF1Q9NS23 344 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USP22Q9UPT9 525 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MPDZO75970 2070 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDZD2O15018 2839 aa10.79□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM72A0PK05 275 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDHR4A6H8M9 788 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 B2RBV5 119 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FRS3O43559 492 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRKD3O94806 890 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PGM3O95394 542 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRG2P13727 222 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TACR3P29371 465 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCKARP32238 428 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCGF2P35227 344 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR2B6P58173 313 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAC3P60763 192 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HOXC5Q00444 222 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCARB2Q14108 478 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VMACQ2NL98 169 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RINLQ6ZS11 566 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DACH2Q96NX9 599 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ECSITQ9BQ95 431 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MED18Q9BUE0 208 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LIME1Q9H400 295 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GLRX2Q9NS18 164 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD300AQ9UGN4 299 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ENO4A6NNW6 628 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C16orf97H3BN30 126 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CASKO14936 926 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 THBS1P07996 1170 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UQCRBP14927 111 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ETS2P15036 469 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AQP1P29972 269 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC1A3P43003 542 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GSK3BP49841 420 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRYBA2P53672 197 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LIPEQ05469 1076 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VEZF1Q14119 521 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP51A1Q16850 503 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNF220Q5VTB9 566 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 REEP3Q6NUK4 255 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C16orf89Q6UX73 402 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC80Q76M96 950 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms