RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 V9GYQ6 96 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.31□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 A0A1W2PRQ8 180 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 DHRS12A0PJE2 317 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CD8B2A6NJW9 211 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CLCA1A8K7I4 914 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 E9PLN8 166 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SULT2B1O00204 365 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TNFSF11O14788 317 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 DNPH1O43598 174 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OR2T1O43869 369 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 KRT36O76013 467 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 PRSS23O95084 383 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 PMS2P2O95744 297 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 GPIP06744 558 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RAP2AP10114 183 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 PLA2G2AP14555 144 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SHC1P29353 583 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 MAGEA2P43356 314 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 UQCRFS1P47985 274 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 DIO1P49895 249 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SMIM11AP58511 58 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RAC3P60763 192 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 VLDLRP98155 873 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 EGR4Q05215 589 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 MYBPHQ13203 477 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 DGCR6Q14129 220 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RTL6Q6ICC9 239 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SPATA24Q86W54 205 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OR6S1Q8NH40 331 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OR10D3Q8NH80 312 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RNF217Q8TC41 542 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 WNT2BQ93097 391 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ARL5BQ96KC2 179 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OR5B2Q96R09 309 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 EPYCQ99645 322 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CHID1Q9BWS9 393 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TINAGQ9UJW2 476 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 MEMO1Q9Y316 297 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF175Q9Y473 711 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 POLEQ07864 2286 aa7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 NBASA2RRP1 2371 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 A0A1W2PNR3 127 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 LIPT2A6NK58 231 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SLC22A20A6NK97 555 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 J3KTA2 159 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 J3QKU1 62 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CCL21O00585 134 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 LRRTM2O43300 516 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 CXCL13O43927 109 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 AHSA1O95433 338 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 SYNGR4O95473 234 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 IGF2P01344 180 aa7.29□□□□□ -1.24
ABCD4-216ENST00000493752 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms