RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.52□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.52□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.52□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.52□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 A6NL46 340 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 BHLHE40O14503 412 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CDK2AP1O14519 115 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PRKYO43930 277 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SUSD5O60279 629 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SNX4O95219 450 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CH25HO95992 272 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CCNA2P20248 432 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CNR1P21554 472 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 POU1F1P28069 291 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SHC1P29353 583 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RPS6KA3P51812 740 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MFAP5Q13361 173 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR1C1Q15619 314 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 BROXQ5VW32 411 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RRM2BQ7LG56 351 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ELOA3Q8NG57 546 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RNF217Q8TC41 542 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR52D1Q9H346 318 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 UBQLN3Q9H347 655 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GPR83Q9NYM4 423 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 VDAC3Q9Y277 283 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.51□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 H3BN98 237 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 KLK10O43240 276 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF208O43345 1280 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SLC2A10O95528 541 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NUDT14O95848 222 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HTR1AP08908 422 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ADRA2AP08913 450 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IMPDH2P12268 514 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CRHBPP24387 322 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ADH6P28332 368 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RRADP55042 308 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NUP107P57740 925 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GPR85P60893 370 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IL5RAQ01344 420 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 APOFQ13790 326 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZBED5Q49AG3 693 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GXYLT1Q4G148 440 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SULF2Q8IWU5 870 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR51A7Q8NH64 312 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 STK35Q8TDR2 534 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM234Q8WY98 164 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HAS2Q92819 552 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF566Q969W8 418 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ARL5BQ96KC2 179 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 DDOQ99489 341 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RNF32Q9H0A6 362 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HHATLQ9HCP6 504 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RASSF1Q9NS23 344 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.5□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms