RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TGM7Q96PF1 710 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FN3KQ9H479 309 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 NLKQ9UBE8 527 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 J3QLW9 94 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 HCN1O60741 890 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IFNA16P05015 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PROS1P07225 676 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF19P17023 458 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SHC1P29353 583 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 EVI2BP34910 448 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR12D2P58182 307 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC3A1Q07837 685 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR4K13Q8NH42 304 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 DGAT2Q96PD7 388 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MCUBQ9NWR8 336 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 STMN3Q9NZ72 180 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SDC3O75056 442 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GPR3P46089 330 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 BLKP51451 505 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF85Q03923 595 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 KCNAB1Q14722 419 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR5W2Q8NH69 310 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TRIM2Q9C040 744 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 POLE3Q9NRF9 147 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ASB6Q9NWX5 421 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SBK2P0C263 348 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC2A5P22732 501 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ACVR1BP36896 505 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GALEQ14376 348 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TOR2AQ5JU69 321 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 BCORP1Q8N888 145 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SPERTQ8NA61 448 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SMPDL3BQ92485 455 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 C4orf36Q96KX1 117 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC38A3Q99624 504 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 JAM3Q9BX67 310 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ALG5Q9Y673 324 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVC2 190 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 A6NIN4 97 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM25AB3EWG3 89 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM25CB3EWG5 89 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM25GB3EWG6 89 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OIP5O43482 229 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR2B3O76000 313 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PEPDP12955 493 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF250P15622 560 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 HK1P19367 917 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FGFBP1Q14512 234 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CDONQ4KMG0 1287 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RTL4Q6ZR62 310 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR10A5Q9H207 317 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CA14Q9ULX7 337 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 EML5Q05BV3 1969 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 C4orf47A7E2U8 309 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MCIDASD6RGH6 385 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CSTAP01040 98 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MAP2K3P46734 347 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CAPZBP47756 277 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FNTBP49356 437 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ATP12AP54707 1039 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PPP3R1P63098 170 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF141Q15928 474 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms