RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM14Q96QK8 99 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PLIN2Q99541 437 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 GAL3ST1Q99999 423 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 AZI2Q9H6S1 392 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TMCO1Q9UM00 188 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVL5 298 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 A8MXQ7 604 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF11O14788 317 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-23P01764 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PTGDSP41222 190 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A2Q6IF42 318 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM69Q86WT6 500 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 RNF126Q9BV68 326 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 MOKQ9UQ07 419 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 VSIG4Q9Y279 399 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF264O43296 627 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A9O60656 530 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 P0C879 139 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 OR3A4PP47883 348 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 QARSP47897 775 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 HSDL2Q6YN16 418 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 CDH26Q8IXH8 852 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 CNDP1Q96KN2 507 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TBX15Q96SF7 602 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF639Q9UID6 485 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 IFT52Q9Y366 437 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF35A5YM69 484 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB10O96000 172 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TPM2P07951 284 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 IL12AP29459 219 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 HTR1FP30939 366 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 BTDP43251 543 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 SPINK14Q6IE38 97 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 RNF2Q99496 336 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 RBKSQ9H477 322 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 GYG1P46976 350 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 DIO3P55073 304 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RIPPLY3P57055 190 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 VGLL4Q14135 290 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ISXQ2M1V0 245 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FTMTQ8N4E7 242 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 IFT74Q96LB3 600 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FOLH1BQ9HBA9 442 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TNRQ92752 1358 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 K7N7A8 449 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN6O00399 190 aa5.63□□□□□ -1.51
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