RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NANOGP8Q6NSW7 305 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PTOV1Q86YD1 416 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ARMC8Q8IUR7 673 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ECSITQ9BQ95 431 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NANOGQ9H9S0 305 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CTAG2O75638 210 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 UGT2B10P36537 528 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NCALDP61601 193 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXC5Q00444 222 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA21Q7Z572 469 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PIGXQ8TBF5 258 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC26A7Q8TE54 656 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PSD2Q9BQI7 771 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 MED18Q9BUE0 208 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM107BQ9H098 131 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PIF1Q9H611 641 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 EVA1AQ9H8M9 152 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 BCO1Q9HAY6 547 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ARMCX1Q9P291 453 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MVM7 634 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 M0QX08 132 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TPST1O60507 370 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 FPR1P21462 350 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 IDUAP35475 653 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC24CP53992 1094 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8J3Q8NGG0 315 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 OR52E4Q8NGH9 312 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TAPBPLQ9BX59 468 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RASSF1Q9NS23 344 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF226Q9NYT6 803 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SELENONQ9NZV5 590 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 EMC3Q9P0I2 261 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ITPR2Q14571 2701 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF724A8MTY0 619 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 MFN2O95140 757 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GOSR1O95249 250 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GPIP06744 558 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 IMPDH2P12268 514 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 KLK2P20151 261 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 BNIP2Q12982 314 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PDK3Q15120 406 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 VMACQ2NL98 169 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOA3BQ3SY89 546 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 POU5F2Q8N7G0 328 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SMYD1Q8NB12 490 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOA3Q8NG57 546 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 C3orf49Q96BT1 292 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM2Q9C040 744 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM27Q9HBJ8 222 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 FREM1Q5H8C1 2179 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GMNCA6NCL1 334 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DYNC1I1O14576 645 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR171O14626 319 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PCGF2P35227 344 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DMTNQ08495 405 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CEACAM7Q14002 265 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OR7A5Q15622 319 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 RABL3Q5HYI8 236 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD34AQ69YU3 496 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TFAP2EQ6VUC0 442 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC103Q8IW40 242 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF100Q8IYN0 542 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF217Q8TC41 542 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 STK35Q8TDR2 534 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR52Q9Y2T5 361 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM221AA4D161 298 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OPN1SWP03999 348 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 COX4I1P13073 169 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP3CBP16298 524 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 LSP1P33241 339 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GNGT1P63211 74 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms