RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 MERTKQ12866 999 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 STK32CQ86UX6 486 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ELOA3Q8NG57 546 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM239Q8WW34 195 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 RASAL1O95294 804 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 CXCR1P25024 350 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 GDF1P27539 372 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 RFC3P40938 356 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PLGLB1Q02325 96 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 CBR4Q8N4T8 237 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC29A1Q99808 456 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 C8orf4Q9NR00 106 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM72A0PK05 275 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 EI24O14681 340 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 SUSD5O60279 629 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PIP5K1CO60331 668 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 OR10H3O60404 316 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 HPNP05981 417 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF17P17021 662 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PTNP21246 168 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 CBLP22681 906 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 DAPP51397 102 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PPP2R2BQ00005 443 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 EGR4Q05215 589 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 DAG1Q14118 895 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 FAHD1Q6P587 224 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 RRM2BQ7LG56 351 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TEX19Q8NA77 164 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 PFN4Q8NHR9 129 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 FEVQ99581 238 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 VCX3BQ9H321 246 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 USE1Q9NZ43 259 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 MED31Q9Y3C7 131 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 GTF3C1Q12789 2109 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ITPR3Q14573 2671 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM166BA8MTA8 275 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ACOT7O00154 380 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 EFNA2O43921 213 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 NPIPB7O75200 414 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 HPRP00739 348 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 IGF2P01344 180 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ALPLP05186 524 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ANXA8P13928 327 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 ELK4P28324 431 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E1-209ENST00000484048 VHLP40337 213 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms