RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	STON2	Q8WXE9	905 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PIF1	Q9H611	641 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ROS1	P08922	2347 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PMS2P2	O95744	297 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ADA	P00813	363 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	BMP2	P12643	396 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ETS2	P15036	469 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	FPR1	P21462	350 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35A1	P78382	337 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	KEAP1	Q14145	624 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SELPLG	Q14242	412 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	OR7A5	Q15622	319 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CGREF1	Q99674	301 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	FAAH	O00519	579 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB7	O75635	380 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HRG	P04196	525 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GPX2	P18283	190 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IST1	P53990	364 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	STK11	Q15831	433 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CASP12	Q6UXS9	341 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MRAS	O14807	208 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF208	O43345	1280 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	LYZL6	O75951	148 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KRT34	O76011	436 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	AKR7A3	O95154	331 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GOSR1	O95249	250 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OPN1SW	P03999	348 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GPI	P06744	558 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	IMPDH2	P12268	514 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PPP3CB	P16298	524 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CRYGS	P22914	178 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KLF10	Q13118	480 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DPP10	Q8N608	796 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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