RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464283.5

CTPS1-205, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-205ENST00000464283 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 HGDQ93099 445 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RELTQ969Z4 430 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CCDC120Q96HB5 630 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 MPP4Q96JB8 637 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 NODALQ96S42 347 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 Q9H521 79 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 DLL4Q9NR61 685 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ACER3Q9NUN7 267 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 U3KQV3 271 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 POLEQ07864 2286 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ESPL1Q14674 2120 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 A0A087WZY1 265 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 A0A0G2JMM0 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 A0A1W2PPB8 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 A0A1W2PRS3 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CLDN24A6NM45 220 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PRSS44E7EML9 344 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 H0YJX3 145 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 J3KTA2 159 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 WIPF1O43516 503 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CHP2O43745 196 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 TPST2O60704 377 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PRSS23O95084 383 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 HPRP00739 348 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 TPOP07202 933 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 GSTM3P21266 225 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CNR1P21554 472 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CXCR1P25024 350 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PEX2P28328 305 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CASP3P42574 277 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SLC1A3P43003 542 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 MAP2K6P52564 334 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SMSP52788 366 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 HMGA2P52926 109 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RAD23AP54725 363 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 UGT2B15P54855 530 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 HOXC5Q00444 222 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 IL1RL1Q01638 556 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF117Q03924 483 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SKP2Q13309 424 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 DAG1Q14118 895 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 NPTX1Q15818 432 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 WLSQ5T9L3 541 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 LPCAT4Q643R3 524 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 LACC1Q8IV20 430 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 CBR4Q8N4T8 237 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 FAM71CQ8NEG0 241 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-205ENST00000464283 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms