RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462715.1

TRAPPC3-205, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 2,428 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-205ENST00000462715 HMGCS1Q01581 520 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ELOCQ15369 112 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 RGNQ15493 299 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 TRAM1Q15629 374 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 SIAH3Q8IW03 269 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 OR14A16Q8NHC5 309 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 OR2M4Q96R27 311 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 OR6C2Q9NZP2 312 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 TMEM218A2RU14 115 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 SDC1P18827 310 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 SMIM11AP58511 58 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 EFNB1P98172 346 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 KCNAB1Q14722 419 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 PRRT3Q5FWE3 981 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 STPG1Q5TH74 334 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ANKRD46Q86W74 232 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 FGF11Q92914 225 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 HBEGFQ99075 208 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 LRRC61Q9BV99 259 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 LRRN3Q9H3W5 708 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 TAS2R5Q9NYW4 299 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 DHRS7Q9Y394 339 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 TMEM131Q92545 1883 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 C4orf47A7E2U8 309 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF749O43361 778 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 TMEM127O75204 238 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 CNR1P21554 472 aa10.62□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 DNLZQ5SXM8 178 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.62□□□□□ -0.71
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TRAPPC3-205ENST00000462715 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 LMX1AQ8TE12 382 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 SAP25Q8TEE9 199 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ESAMQ96AP7 390 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ART5Q96L15 291 aa10.62□□□□□ -0.71
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.62□□□□□ -0.71
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