RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 DNPH1O43598 174 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PRG2P13727 222 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA9Q9BWV2 254 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 RABEP2Q9H5N1 569 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 IKZF5Q9H5V7 419 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF446Q9NWS9 450 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM181Q9P2C4 612 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF232Q9UNY5 417 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 IFT52Q9Y366 437 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZFHX3Q15911 3703 aa21■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF716A6NP11 495 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PDK3Q15120 406 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 TSC22D1Q15714 1073 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 BBS10Q8TAM1 723 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 S100PBPQ96BU1 408 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 DDIT4LQ96D03 193 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS50Q9UI38 385 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 RAMP1O60894 148 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PGM3O95394 542 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ADAP00813 363 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ARAFP10398 606 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 IMPDH2P12268 514 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CD53P19397 219 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 MAP2K6P52564 334 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 OR2B6P58173 313 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 H3F3AP84243 136 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SFRP5Q5T4F7 317 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 Q6ZT83 130 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINA11Q86U17 422 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0G2JND7 137 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 C5orf58C9J3I9 102 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 P2RY6Q15077 328 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB113Q30KQ7 82 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 BEX5Q5H9J7 111 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC103Q8IW40 242 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CADM2Q8N3J6 435 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PIGXQ8TBF5 258 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 EMC3Q9P0I2 261 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NF1P21359 2839 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ETS2P15036 469 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SLC16A1P53985 500 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 COPZ1P61923 177 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 WFDC8Q8IUA0 241 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 PLCE1Q9P212 2302 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 FRS3O43559 492 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 GPX2P18283 190 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 IL32P24001 234 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CXCR1P25024 350 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NTF4P34130 210 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 SLC35A1P78382 337 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CDK6Q00534 326 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 ITGADQ13349 1161 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 REEP3Q6NUK4 255 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP20.96■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 25.1
HOXB3-202ENST00000460160 USF3Q68DE3 2245 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB3-202ENST00000460160 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 FPR1P21462 350 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 BNIP2Q12982 314 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 ADRM1Q16186 407 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 RETREG3Q86VR2 466 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 DPP10Q8N608 796 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 SLC35B4Q969S0 331 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 C3orf49Q96BT1 292 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 UBTD1Q9HAC8 227 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 EVPLLA8MZ36 301 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 PRKAR1BP31321 381 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 HOXC5Q00444 222 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 TAB1Q15750 504 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB3-202ENST00000460160 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms