RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 AMY2BP19961 511 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LAP3P28838 519 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 DLX5P56178 289 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TLE2Q04725 743 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NLRP8Q86W28 1048 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TRIB2Q92519 343 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 BTF3L4Q96K17 158 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RHOVQ96L33 236 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRRC1Q96M27 445 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 P2RY12Q9H244 342 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR51M1Q9H341 326 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 APMAPQ9HDC9 416 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RLIMQ9NVW2 624 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 A0A1W2PPK0 400 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 E9PI62 339 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC25A17O43808 307 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TSPAN12O95859 305 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 IFNA10P01566 189 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CD34P28906 385 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RAB33AQ14088 237 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TMEM225Q6GV28 225 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SSX6Q7RTT6 188 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PDZD3Q86UT5 571 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CPXM2Q8N436 756 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GPR148Q8TDV2 347 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NEIL2Q969S2 332 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 IL17FQ96PD4 163 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRRT1Q99946 306 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MED18Q9BUE0 208 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C5AR2Q9P296 337 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LHX3Q9UBR4 397 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 DKKL1Q9UK85 242 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LY75O60449 1722 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CBY3A6NI87 242 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 VSTM2BA6NLU5 285 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 B4DGG1 531 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 B4GALT2O60909 372 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRSS23O95084 383 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PEX11BO96011 259 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 IFNA4P05014 189 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PCMT1P22061 227 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GJA5P36382 358 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GIPRP48546 466 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FXYD6P3P58550 94 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MALLQ13021 153 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RNF128Q8TEB7 428 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TM9SF4Q92544 642 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KCNK6Q9Y257 313 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FAM227AF5H4B4 570 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 HCRTR2O43614 444 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RDH16O75452 317 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GPX5O75715 221 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KCNK2O95069 426 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PNPP00491 289 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.94□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 UGT2B7P16662 529 aa5.94□□□□□ -1.46
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