RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 GIFP27352 417 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 H3F3AP84243 136 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CHRNEQ04844 493 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 BST1Q10588 318 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SKP2Q13309 424 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CBFBQ13951 182 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 GGTLC2Q14390 218 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 QPRTQ15274 297 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 IMPG1Q17R60 797 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CR1LQ2VPA4 569 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CDC73Q6P1J9 531 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 DEF8Q6ZN54 512 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 HPS1Q92902 700 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CDS1Q92903 461 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 APH1AQ96BI3 265 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC126Q96EE4 140 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 NSL1Q96IY1 281 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 OR5B2Q96R09 309 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SOX7Q9BT81 388 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 LAT2Q9GZY6 243 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ACER3Q9NUN7 267 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 MRGBPQ9NV56 204 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 C1orf109Q9NX04 203 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 FKBP7Q9Y680 259 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 TGP01266 2768 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PR80 420 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SERINC4A6NH21 518 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 G3V2L1 256 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SULT2B1O00204 365 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SLC28A1O00337 649 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF264O43296 627 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ATP6V1G2O95670 118 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 PMS2P2O95744 297 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 IGHV3-9P01782 118 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 PROCP04070 461 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 GUSBP08236 651 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 TACSTD2P09758 323 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 CPA3P15088 417 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ITGA2P17301 1181 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 EGR1P18146 543 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ATP6V1C1P21283 382 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SERPINB5P36952 375 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SLC1A6P48664 564 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SESN3P58005 492 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 DNAJB13P59910 316 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SLC25A3Q00325 362 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF141Q15928 474 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SYT14P1Q58G82 188 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 CFAP157Q5JU67 520 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 DCST2Q5T1A1 773 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ASRGL1Q7L266 308 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 EMCNQ9ULC0 261 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 B9A039 149 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00578-201ENST00000439009 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms