RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAB34Q9BZG1 259 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBKSQ9H477 322 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 EHD1Q9H4M9 534 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TIGARQ9NQ88 270 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHF11Q9UIL8 331 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMCO2A6NFE2 343 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 A8MXK9 166 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 IDSB3KWA1 339 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 E9PLD3 99 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 G3V3Y1 287 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GFYI3L273 518 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 HSD17B6O14756 317 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TOM1O60784 492 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SH3BGRLO75368 114 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 UGT2B17O75795 530 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 NOL4O94818 638 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LYPD3O95274 346 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGLV1-44P01699 117 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGFBP5P24593 272 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LMO2P25791 158 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPHX2P34913 555 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ALDH3B2P48448 385 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNJ2P63252 427 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRB7Q14451 532 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLHL40Q2TBA0 621 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LEMD1Q68G75 181 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF614Q8N883 585 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR7G2Q8NG99 324 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRRC1Q96M27 445 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSDMAQ96QA5 445 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMBNQ9NP70 447 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 NANSQ9NR45 359 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARMCX1Q9P291 453 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 COPS3Q9UNS2 423 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF487B1APH4 448 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SULT2B1O00204 365 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPX5O75715 221 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLITRK3O94933 977 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR2F2O95006 317 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC2A10O95528 541 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf105O95561 183 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LGI1O95970 557 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSTAP01040 98 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANXA5P08758 320 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF24P17028 368 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF43P17038 809 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 HTR1FP30939 366 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OPRD1P41143 372 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSSP48637 474 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAB9AP51151 201 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 BCAP31P51572 246 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 PKNOX1P55347 436 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LTB4RQ15722 352 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 VWA2Q5GFL6 755 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 BEST4Q8NFU0 473 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms