RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 DDIT4LQ96D03 193 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 MBD6Q96DN6 1003 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0G2JND7 137 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF716A6NP11 495 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 C5orf58C9J3I9 102 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ATE1O95260 518 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PRG2P13727 222 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 GPX2P18283 190 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 LOXP28300 417 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 COPZ1P61923 177 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 GCNT6Q5T4J0 391 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 WBP2NLQ6ICG8 309 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35B4Q969S0 331 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 IKZF5Q9H5V7 419 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 EVPLLA8MZ36 301 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 KLF4O43474 513 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 IMPDH2P12268 514 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCR1P25024 350 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC16A1P53985 500 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2B6P58173 313 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK6Q00534 326 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 KEAP1Q14145 624 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 P2RY6Q15077 328 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 Q6ZT83 130 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SERPINA11Q86U17 422 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 DPP10Q8N608 796 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGXQ8TBF5 258 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPEARQ8WU66 669 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEKPQ9BYX7 375 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 EMC3Q9P0I2 261 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAP00813 363 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 EDNRAP25101 427 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35A1P78382 337 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGADQ13349 1161 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 BEX5Q5H9J7 111 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 REEP3Q6NUK4 255 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CADM2Q8N3J6 435 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS50Q9UI38 385 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR171O14626 319 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ANGPT2O15123 496 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 RAMP1O60894 148 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CD53P19397 219 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 FPR1P21462 350 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAR1BP31321 381 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC103Q8IW40 242 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 S100PBPQ96BU1 408 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 IL32P24001 234 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 TSC22D1Q15714 1073 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ADRM1Q16186 407 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 RETREG3Q86VR2 466 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT73Q86Y46 540 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 WFDC8Q8IUA0 241 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 C3orf49Q96BT1 292 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 DSCAMO60469 2012 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 FRS3O43559 492 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC6A2P23975 617 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 NTF4P34130 210 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 IDUAP35475 653 aa18.22■□□□□ 0.51
UBE2E3-201ENST00000392415 SCARB2Q14108 478 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms