RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 FUZQ9BT04 418 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 MED18Q9BUE0 208 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 TEX12Q9BXU0 123 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 EQTNQ9NQ60 294 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 C1orf109Q9NX04 203 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 MED12LQ86YW9 2145 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 C16orf97H3BN30 126 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CRCPO75575 148 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ACP2P11117 423 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PRPS2P11908 318 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FCGR2AP12318 317 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CPA3P15088 417 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC6A9P48067 706 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 LTBQ06643 244 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PCLAFQ15004 111 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 DUSP5Q16690 384 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CFAP157Q5JU67 520 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 Q5PR19 223 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 LIPMQ5VYY2 423 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KRT80Q6KB66 452 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GALNT10Q86SR1 603 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 OR4C3Q8NH37 302 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SETD6Q8TBK2 473 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FAM110BQ8TC76 370 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GPR151Q8TDV0 419 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PIGTQ969N2 578 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SPSB4Q96A44 273 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ARSGQ96EG1 525 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FOXB1Q99853 325 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 NELFAQ9H3P2 528 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 REEP4Q9H6H4 257 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PROCRQ9UNN8 238 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 VDAC3Q9Y277 283 aa6.23□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 A0A087WZY1 265 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PRB8 838 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC28A1O00337 649 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 AZIN1O14977 448 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMDEC1O15204 470 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 RGS14O43566 566 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GMFGO60234 142 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SMPD2O60906 423 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KCNK2O95069 426 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 HEXAP06865 529 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 NEFHP12036 1026 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 FPR1P21462 350 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 TBXA2RP21731 343 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC18A2Q05940 514 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 COX10Q12887 443 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CDK5R2Q13319 367 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CD226Q15762 336 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 ACKR1Q16570 336 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 KANK2Q63ZY3 851 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 Q8N1Y9 231 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 GATSQ8NAP1 163 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 NUP43Q8NFH3 380 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-201ENST00000379445 OR10D3Q8NH80 312 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms