RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 C8orf4Q9NR00 106 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 TMEM251Q8N6I4 163 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 DGCR6LQ9BY27 220 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNX15-202ENST00000377244 OR2M5A3KFT3 312 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 H3BML4 177 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SOX14O95416 240 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 FAM87AP0C7U9 286 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 EPHA2P29317 976 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 IFNGR2P38484 337 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TMEM44Q2T9K0 475 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TOR3AQ9H497 397 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ACACBO00763 2458 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 KLF4O43474 513 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 CTBP2P56545 445 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 MBOAT4Q96T53 435 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ITGB2P05107 769 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SHC1P29353 583 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 GSSP48637 474 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TAAR8Q969N4 342 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ARL5BQ96KC2 179 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 UCK2Q9BZX2 261 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 CH25HO95992 272 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ADH6P28332 368 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 LINC00303Q3SY05 128 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SLC19A3Q9BZV2 496 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 A8MVM7 634 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 NPIPB7O75200 414 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 FPR3P25089 353 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TSPAN31Q12999 210 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 Q6ZS92 163 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 KIF18BQ86Y91 864 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SFTPDP35247 375 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 RAD23AP54725 363 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 LTBQ06643 244 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 GXYLT1Q4G148 440 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SMPDL3BQ92485 455 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SGTBQ96EQ0 304 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 LUZP4Q9P127 313 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 H0YJX3 145 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TFPIP10646 304 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SELENBP1Q13228 472 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SLC36A3Q495N2 470 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SYT14P1Q58G82 188 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 CDK20Q8IZL9 346 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 CYGBQ8WWM9 190 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 DNAJC9Q8WXX5 260 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 PIGQQ9BRB3 760 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TMEM5Q9Y2B1 443 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 SLC6A5Q9Y345 797 aa22.91■■□□□ 1.26
SNX15-202ENST00000377244 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms