RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369068.4

RPRD2-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD2, Length 4,612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2-202ENST00000369068 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TUBB1Q9H4B7 451 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 CWH43Q9H720 699 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 A0A0U1RQK1 487 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TUBAL3A6NHL2 446 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 BRINP1O60477 761 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TRAPPC6AO75865 159 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SCGB1D1O95968 90 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 HOXB2P14652 356 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SYN1P17600 705 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ELK1P19419 428 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ACSM1Q08AH1 577 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TNK1Q13470 666 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 GAB1Q13480 694 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 RIN1Q13671 783 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 GPR18Q14330 331 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SAXO2Q658L1 398 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 FIGLAQ6QHK4 219 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 VRK2Q86Y07 508 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 RAB39BQ96DA2 213 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 BTBD2Q9BX70 525 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 A0A0U1RQS6 177 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZNF195O14628 629 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 GPX5O75715 221 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 STK17BO94768 372 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SERPINA7P05543 415 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NDUFA6P56556 154 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TAS2R46P59540 309 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR1Q1Q15612 314 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 DEFB115Q30KQ5 88 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 Q499Y3 187 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 C17orf107Q6ZR85 190 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZBTB44Q8NCP5 570 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZNF480Q8WV37 535 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ASB17Q8WXJ9 295 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR7D2Q96RA2 312 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MYADMQ96S97 322 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TGIF2Q9GZN2 237 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TMEM38AQ9H6F2 299 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 FBRSQ9HAH7 460 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 KPTNQ9Y664 436 aa10□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TAS2R30P59541 319 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SPOCK1Q08629 439 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 AQP6Q13520 282 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 XKR7Q5GH72 579 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 CDS1Q92903 461 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 C14orf79Q96F83 325 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NFKBIEO00221 500 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MSR1P21757 451 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 CD70P32970 193 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TOR2AQ5JU69 321 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 GKN2Q86XP6 184 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 C12orf57Q99622 126 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ASIC5Q9NY37 505 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 EHFQ9NZC4 300 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TMEM212A6NML5 194 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 CD300LBA8K4G0 201 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MALLQ13021 153 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 RNF175Q8N4F7 328 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 CHST14Q8NCH0 376 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 YIPF5Q969M3 257 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 TMEM106AQ96A25 262 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 YIPF6Q96EC8 236 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 OR1F2PQ96R84 312 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 PDE7BQ9NP56 450 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 INIPQ9NRY2 104 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD2-202ENST00000369068 NUMA1Q14980 2115 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms