RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 A0A1W2PQ72 361 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SERINC4A6NH21 518 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ITGA10O75578 1167 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CRYZL1O95825 349 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LGI1O95970 557 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM239Q8WW34 195 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SARGQ9BW04 601 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 STMN3Q9NZ72 180 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SNX4O95219 450 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CD59P13987 128 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 NID1P14543 1247 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ST3GAL4Q11206 333 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CDC20Q12834 499 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SYT14Q8NB59 555 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 GNRHR2Q96P88 292 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CDC6Q99741 560 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LANCL2Q9NS86 450 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 U3KQA8 63 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SMLR1H3BR10 107 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 M0R082 166 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC16A6O15403 523 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OIP5O43482 229 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TACR3P29371 465 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 HOXA6P31267 233 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 HTR3AP46098 478 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PROX2Q3B8N5 592 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LRR1Q96L50 414 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR1F2PQ96R84 312 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF559Q9BR84 538 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.56□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PPP1R3DO95685 299 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CRISP1P54107 249 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PLGLB1Q02325 96 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SPATS1Q496A3 300 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 KMT5CQ86Y97 462 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 LNX2Q8N448 690 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 GIMAP5Q96F15 307 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 NANSQ9NR45 359 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF264O43296 627 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 DNAJB5O75953 348 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 SLC2A10O95528 541 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF806P0C7X5 589 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 CHMP24386 653 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 NCF4Q15080 339 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 FANK1Q8TC84 345 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 MVB12AQ96EY5 273 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 OR5M11Q96RB7 305 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.55□□□□□ -0.08
PDGFB-201ENST00000331163 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms