RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 COPS3Q9UNS2 423 aa23.3■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 PLSCR5A0PG75 271 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 LINC00303Q3SY05 128 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 DCST2Q5T1A1 773 aa23.29■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 TBC1D3EA0A087X179 549 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 CTDSPLO15194 276 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 EPCAMP16422 314 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 DEFB134Q4QY38 66 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 EIPR1Q53HC9 387 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 CTRB2Q6GPI1 263 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 ALKAL2Q6UX46 152 aa23.28■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 CDK20Q8IZL9 346 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 C2orf42Q9NWW7 574 aa23.28■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 LHFPL5Q8TAF8 219 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 OR1F2PQ96R84 312 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.27■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 CSF2RAP15509 400 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 SRMP19623 302 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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SENP3-201ENST00000321337 COQ8AQ8NI60 647 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 PPA2Q9H2U2 334 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 NTMQ9P121 344 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 L7N2F9 121 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SELENOFO60613 162 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 LDB3O75112 727 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 STX11O75558 287 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PPM1BO75688 479 aa23.26■■□□□ 1.31
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