RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CD53P19397 219 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 LAP3P28838 519 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 NTSP30990 170 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 LCN1P31025 176 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEA2P43356 314 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 AKR1C2P52895 323 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 AKR1C1Q04828 323 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM64Q6YI46 380 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CBLL1Q75N03 491 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 MACROD1Q9BQ69 325 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 LYRM4Q9HD34 91 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GVC2 190 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM82A0PJX8 343 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 A6NIN4 97 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 H0YGG7 62 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SLC31A2O15432 143 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SSNA1O43805 119 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CERS1P27544 350 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 BTN3A2P78410 334 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 DMWDQ09019 674 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SKP2Q13309 424 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 GPR176Q14439 515 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 LDLRAD3Q86YD5 345 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SFXN5Q8TD22 340 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 MOAP1Q96BY2 351 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 TEX12Q9BXU0 123 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0G2JN53 185 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SULT1C2O00338 296 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 ICOSLGO75144 302 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 AIFM1O95831 613 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SEMG1P04279 462 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 H2AFB2P0C5Z0 115 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CXCL2P19875 107 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CRATP43155 626 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SELENOPP49908 381 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 RAB8AP61006 207 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 BICRALQ6AI39 1079 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 C22orf42Q6IC83 251 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CARFQ8N187 725 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 CREB3L1Q96BA8 519 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 HHATLQ9HCP6 504 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 P2RX6O15547 441 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 C1QCP02747 245 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SPCS3P61009 180 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 SYT14Q8NB59 555 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 B3GNT7Q8NFL0 401 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 ELP5Q8TE02 316 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 GATAD2BQ8WXI9 593 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 C14orf144Q96I85 54 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 FCRL4Q96PJ5 515 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXA3-201ENST00000317201 GPR171O14626 319 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 LANCL1O43813 399 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 B3GALT2O43825 422 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 DPM1O60762 260 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SDC3O75056 442 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 POU4F2Q12837 409 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 FAM198BQ6UWH4 519 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 OR1S1Q8NH92 325 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TCTN2Q96GX1 697 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 DISC1C4P0D8 188 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 L7N2F9 121 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 STATHP02808 62 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 S100A8P05109 93 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NUDT7P0C024 238 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ARAFP10398 606 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms