RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 CCR4P51679 360 aa21.94■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 OR1L3Q8NH93 324 aa21.94■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.94■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 OIP5O43482 229 aa21.93■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 SSX6Q7RTT6 188 aa21.93■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 ACOT12Q8WYK0 555 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 TFP02787 698 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 OR5J2Q8NH18 312 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC19A2O60779 497 aa21.9■■□□□ 1.1
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TRIM54-201ENST00000296098 MYL9P24844 172 aa21.9■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
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