RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAKP20794 623 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1D4P47884 311 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 EMDP50402 254 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLBD1Q6P4A8 553 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 LAPTM4BQ86VI4 370 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR13C2Q8NGS9 318 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ASB15Q8WXK1 588 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RFKQ969G6 155 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ART5Q96L15 291 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBX5Q99593 518 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRSS27Q9BQR3 290 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 Q9N2J8 555 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAV27A0A087WT01 109 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 NKX2-2O95096 273 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDUFAF6Q330K2 333 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 GATSQ8NAP1 163 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 BPIFA2Q96DR5 249 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBQLN3Q9H347 655 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HPF1Q9NWY4 346 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 MGAT4AQ9UM21 535 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 C10orf142B7Z368 130 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SURF4O15260 269 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 FABP7O15540 132 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 NOS3P29474 1203 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB40BQ12829 278 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR51G2Q8NGK0 314 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC22A4Q9H015 551 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SOCS6O14544 535 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAICSP22234 425 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 WNT4P56705 351 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1D5P58170 312 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HLA-CQ95604 372 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC14L4Q9UDX3 406 aa19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAV6A0A075B6T7 132 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGKV1D-16P01601 117 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIR2DL3P43628 341 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB14P61106 215 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 PYDC2Q56P42 97 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR51V1Q9H2C8 321 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOXO94900 526 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNX4O95219 450 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HMGN1P05114 100 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 C22orf42Q6IC83 251 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEX261Q6UWH6 196 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR6M1Q8NGM8 313 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HS6ST2Q96MM7 605 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAPBPLQ9BX59 468 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 EDARQ9UNE0 448 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 STUB1Q9UNE7 303 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 BAIAP2Q9UQB8 552 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 U3KQ87 197 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCKDHBP21953 392 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 CD79BP40259 229 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 FNTBP49356 437 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCR4P51679 360 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCRN3Q0VDG4 424 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 C16orf52Q8NHV5 167 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZDHHC12Q96GR4 267 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 NELL2Q99435 816 aa19.29■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RP1P56715 2156 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A1B0GWA3 101 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 TLCD2A6NGC4 264 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM25EA8MYX2 175 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 BET1O15155 118 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 S1PR1P21453 382 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 CD1CP29017 333 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS19P39019 145 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCN1BQ07699 218 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 FZD5Q13467 585 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR10A5Q9H207 317 aa19.28■□□□□ 0.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms