RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GPR148Q8TDV2 347 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PIGKQ92643 395 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 BMFQ96LC9 184 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PDE7BQ9NP56 450 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPK0 400 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CTNSO60931 367 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GLCEO94923 617 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AHSA1O95433 338 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TYRP1P17643 537 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAG2P55895 527 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HES5Q5TA89 166 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CA13Q8N1Q1 262 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MEGF11A6BM72 1044 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SPINT1O43278 529 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TGM4P49221 684 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MMP15P51511 669 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ACTBP60709 375 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ACTG1P63261 375 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RIN1Q13671 783 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RUNX2Q13950 521 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GPR18Q14330 331 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GRM7Q14831 915 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM234Q8WY98 164 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PEX11GQ96HA9 241 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CD3GP09693 182 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DRD3P35462 400 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RFX2P48378 723 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AKR1D1P51857 326 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CCDC157Q569K6 752 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SIAH3Q8IW03 269 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TCTN2Q96GX1 697 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NCDNQ9UBB6 729 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DHDHQ9UQ10 334 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 I3L521 148 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IFNA6P05013 189 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SYPP08247 313 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DIO1P49895 249 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CCR9P51686 369 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SNTA1Q13424 505 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IL10RAQ13651 578 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FCN2Q15485 313 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 C4orf46Q504U0 113 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 UCN3Q969E3 161 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SMIM19Q96E16 107 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR10A4Q9H209 315 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MSL3P1P0C860 447 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GDNFP39905 211 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FGL1Q08830 312 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 Q499Y3 187 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 EMC4Q5J8M3 183 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TIGD4Q8IY51 512 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DTX3Q8N9I9 347 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 C5orf34Q96MH7 638 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms