RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 CTSHP09668 335 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 SERPINA2P20848 420 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 NFYBP25208 207 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 EPHA2P29317 976 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 MTNR1BP49286 362 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 OR4D1Q15615 310 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 MOAP1Q96BY2 351 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 CMKLR1Q99788 373 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.96□□□□□ -0.81
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1W2PPQ1 181 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 DPYSL4O14531 572 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 HOXB5P09067 269 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SSR2P43308 183 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 MAPK8P45983 427 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 P2RY4P51582 365 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ZXDBP98169 803 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CBLL1Q75N03 491 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CPOQ8IVL8 374 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 FIBINQ8TAL6 211 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SMPDL3BQ92485 455 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 RTP4Q96DX8 246 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 KLHL15Q96M94 604 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.96□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 XKRYO14609 159 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BCL2L11O43521 198 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 EDIL3O43854 480 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 VTNP04004 478 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 FBXO45P0C2W1 286 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CDKN2DP55273 166 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SERINC5Q86VE9 423 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 OR56A3Q8NH54 315 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 FAM3CQ92520 227 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 KIRREL1Q96J84 757 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 OR5H15A6NDH6 313 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 OR5H1A6NKK0 313 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 GPR39O43194 453 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ACP2P11117 423 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CLDN12P56749 244 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BTF3L4Q96K17 158 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 C2orf78A6NCI8 922 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 UNC119BA6NIH7 251 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 WNT10BO00744 389 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PLA2G10O15496 165 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 TBX19O60806 448 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 C22orf31O95567 290 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PMS2P2O95744 297 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 KNG1P01042 644 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 HLA-DQB2P05538 268 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CD82P27701 267 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CTSCP53634 463 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CAPSQ13938 189 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 VEZF1Q14119 521 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 FUT10Q6P4F1 479 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 LRP11Q86VZ4 500 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SLC35G3Q8N808 338 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 THEM6Q8WUY1 208 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 BORCS7Q96B45 105 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 RASD2Q96D21 266 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PDXPQ96GD0 296 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PRRT1Q99946 306 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 SLC32A1Q9H598 525 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 ACOD1A6NK06 481 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 DIRAS3O95661 229 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 AIFM1O95831 613 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 GBAP04062 536 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 EPHX1P07099 455 aa9.95□□□□□ -0.82
KPNA3-201ENST00000261667 GABRA2P47869 451 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms