RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261205.8

SYT1-201, Transcript of synaptotagmin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT1, Length 4,808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1-201ENST00000261205 PMS2CLQ68D20 193 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SLC15A4Q8N697 577 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 RAD51DO75771 328 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GM2AP17900 193 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 BCKDHBP21953 392 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CHMP24386 653 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF425Q6IV72 752 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ISOC1Q96CN7 298 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 LRFN5Q96NI6 719 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 DISC1C4P0D8 188 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GPRIN2O60269 458 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TNFRSF21O75509 655 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ARPC4P59998 168 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 MUCL1Q96DR8 90 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 FRMD6Q96NE9 622 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 STK17BO94768 372 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 RIN1Q13671 783 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GIMAP5Q96F15 307 aa14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 AGAP5A6NIR3 686 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 LINC01387J3KSC0 135 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 UPK1AO00322 258 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR7A10O76100 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 DRD5P21918 477 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 MAN2A2P49641 1150 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 MARCH3Q86UD3 253 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 FN3KQ9H479 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ASB4Q9Y574 426 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 FAM25EA8MYX2 175 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CDK1P06493 297 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 PRKXP51817 358 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 BTG2P78543 158 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TEX19Q8NA77 164 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SYT14Q8NB59 555 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR8S1Q8NH09 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TSLPQ969D9 159 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 DNAJB6O75190 326 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SELENBP1Q13228 472 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CHRM4P08173 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CD79AP11912 226 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 IL32P24001 234 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CBX3Q13185 183 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 RAB9BQ9NP90 201 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 MALT1Q9UDY8 824 aa14.66□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 A6NLC8 198 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 GASTP01350 101 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 RAB3BP20337 219 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 NINJ1Q92982 152 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 FAM46BQ96A09 425 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 RADILQ96JH8 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 HHLA2Q9UM44 414 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 J3KTA2 159 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ENTPD1P49961 510 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 HBMQ6B0K9 141 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 HTRA1Q92743 480 aa14.65□□□□□ -0.06
SYT1-201ENST00000261205 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms