RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 JAM3Q9BX67 310 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 C12orf10Q9HB07 376 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 MPDZO75970 2070 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 MCIDASD6RGH6 385 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 SP9P0CG40 484 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 MST1P26927 711 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 MPLP40238 635 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 EFR3AQ14156 821 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ACBD7Q8N6N7 88 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TM9SF4Q92544 642 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 LRFN5Q96NI6 719 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TEAD3Q99594 435 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC26A1Q9H2B4 701 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 PALMDQ9NP74 551 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 NANSQ9NR45 359 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRNA9Q9UGM1 479 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 METTL15A6NJ78 407 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CXCR1P25024 350 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYBB2P43320 205 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CBFBQ13951 182 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 LCN10Q6JVE6 187 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52N1Q8NH53 320 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5W2Q8NH69 310 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 NUBPLQ8TB37 319 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF74Q16587 644 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4K13Q8NH42 304 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM19Q9H013 955 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CORINQ9Y5Q5 1042 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 FADS1O60427 444 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 GP1BBP13224 206 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CD79BP40259 229 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TPBGQ13641 420 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 GXYLT1Q4G148 440 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ASPNQ9BXN1 380 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 FRYLO94915 3013 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 DAPL1A0PJW8 107 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 J3QRE1 110 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 GDF9O60383 454 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CLUP10909 449 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 P2RX1P51575 399 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKDD1AQ495B1 522 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR10H4Q8NGA5 316 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5L2Q8NGL0 311 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEAL3Q969E4 200 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM203Q969S6 136 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa21.83■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC182A6NF36 153 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC30A4O14863 429 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 IDUAP35475 653 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 POMZP3Q6PJE2 187 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 BMPERQ8N8U9 685 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF485Q8NCK3 441 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf44Q96CB5 159 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 DACH2Q96NX9 599 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 TBX5Q99593 518 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHDC3Q9BQ90 382 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 MMP25Q9NPA2 562 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 C17orf51A8MQB3 221 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 GYPBP06028 91 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 CYC1P08574 325 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A5P22732 501 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC26A5P58743 744 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 EGR4Q05215 589 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 POU4F2Q12837 409 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1-201ENST00000007264 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms