RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPM1	P09493	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ALPI	P09923	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	UCHL3	P15374	230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C4BPB	P20851	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GIF	P27352	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ETV5	P41161	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLK7	P49862	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CSRP3	P50461	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCR4	P51679	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SST	P61278	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CEBPE	Q15744	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	INA	Q16352	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	COQ7	Q99807	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRP4	O75096	1905 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPTA1	P02549	2419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		F8VZ95	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NME2P1	O60361	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SOCS5	O75159	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PALM	O75781	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LYN	P07948	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCL4	P13236	92 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPX3	P22352	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRDX6	P30041	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RGR	P47804	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC26A5	P58743	744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q6ZSR9	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ARC	Q7LC44	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHP1	Q99653	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAST4	O15021	2626 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0U1RQS6	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		A8MU76	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	DFFA	O00273	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHEK1	O14757	476 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	KRT86	O43790	486 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF432	O94892	652 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	AKR7A3	O95154	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYNGR4	O95473	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GUCA1C	O95843	209 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TXNDC12	O95881	172 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LIPC	P11150	499 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GNB3	P16520	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCL11	P51671	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPI1	P60174	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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