RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 THSD1Q9NS62 852 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKMY1Q9P2S6 941 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 BLACEA4D250 179 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CDHR4A6H8M9 788 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SPP1P10451 314 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CD1DP15813 335 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ENPP1P22413 925 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ITGB8P26012 769 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 HLA-FP30511 346 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CNR2P34972 360 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ETV4P43268 484 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 HLCSP50747 726 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 RRADP55042 308 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 LMAN2Q12907 356 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 GAB1Q13480 694 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF266Q14584 549 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SSX9Q7RTT3 188 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF546Q86UE3 836 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SCAMP4Q969E2 229 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TCTN2Q96GX1 697 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SMOQ99835 787 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 FZD8Q9H461 694 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SCML1Q9UN30 329 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 GAB2Q9UQC2 676 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 RASD1Q9Y272 281 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A0J9YY10 115 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A0U1RQF3 1178 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 YIF1AO95070 293 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 FCGR2AP12318 317 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNE1P15382 129 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 EDDM3BP56851 147 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 GNB1P62873 340 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 LTBQ06643 244 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC36A2Q495M3 483 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OPN5Q6U736 354 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CPOQ8IVL8 374 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM239Q8WW34 195 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 S1PR3Q99500 378 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OBP2AQ9NY56 170 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5K3A6NET4 321 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 HSPB6O14558 160 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 XRCC3O43542 346 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NXPH2O95156 264 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 THBS1P07996 1170 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CNR1P21554 472 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 PSMB10P40306 273 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR4P57081 412 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ACSM1Q08AH1 577 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 MAP4K2Q12851 820 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 LPAL2Q16609 132 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 BTNL8Q6UX41 500 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINA11Q86U17 422 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 GLB1L2Q8IW92 636 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRC18Q8N456 261 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 FNDC8Q8TC99 324 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 TGIF2Q9GZN2 237 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NIPAL2Q9H841 368 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-215ENST00000624145 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms