RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS35Q96QK1 796 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3GL1Q99961 368 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPKQ9BS16 269 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DPY30Q9C005 99 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTR8Q9H981 624 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PARVBQ9HBI1 364 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf4Q9NR00 106 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf109Q9NX04 203 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CMTM6Q9NX76 183 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE10AQ9Y233 779 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GVT2 93 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ASPDHA6ND91 283 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LILRA5A6NI73 299 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MANBAO00462 879 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MID1O15344 667 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SPRY3O43610 288 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 PDYNP01213 254 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CATP04040 527 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IL6P05231 212 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CISD3P0C7P0 127 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE12FP0CL80 117 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE12IP0CL82 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH1P12830 882 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMC3P17980 439 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MNDAP41218 407 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE4Q13068 117 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 CYP51A1Q16850 503 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPJQ5W064 366 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM215Q68D42 235 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT2A3Q6UWM9 527 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNEQ86WN2 208 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD8Q92502 1023 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GGHQ92820 318 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GLYATL1Q969I3 302 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM159Q96B96 161 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 COQ8BQ96D53 544 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC45A3Q96JT2 553 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX37Q96LM6 180 aa3.78□□□□□ -1.8
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