RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 MERTKQ12866 999 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SKP2Q13309 424 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IL18R1Q13478 541 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TGIF1Q15583 401 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR1Q1Q15612 314 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FGD3Q5JSP0 725 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TTC23Q5W5X9 447 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 STK32CQ86UX6 486 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR6S1Q8NH40 331 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DOK4Q8TEW6 326 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZG16BQ96DA0 208 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PKP2Q99959 881 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PIGQQ9BRB3 760 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.345e-7■■□□□ 12.5
SMAD4-210ENST00000590061 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TIGARQ9NQ88 270 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 USE1Q9NZ43 259 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 USP22Q9UPT9 525 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 V9GYQ6 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087WUJ7 227 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087WV48 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SNTNA6NMZ2 147 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 A8MVM7 634 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 H0YAE9 185 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 K7ENP7 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DNPH1O43598 174 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR10H3O60404 316 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MPZL2O60487 215 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR6B1O95007 311 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RCBTB2O95199 551 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MT-ATP6P00846 226 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SP1P08047 785 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRKAR1AP10644 381 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ACADSP16219 412 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CD96P40200 585 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR1E2P47887 323 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CCL11P51671 97 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CCR4P51679 360 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SESN3P58005 492 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CSNK2BP67870 215 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TUBA3CQ13748 450 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DAG1Q14118 895 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR1C1Q15619 314 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MAPK14Q16539 360 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF605Q86T29 641 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MARCH3Q86UD3 253 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 VASH2Q86V25 355 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRR22Q8IZ63 422 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BEST3Q8N1M1 668 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PARP8Q8N3A8 854 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CADM2Q8N3J6 435 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms