RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ACER3Q9NUN7 267 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 AGAP5A6NIR3 686 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GKN3PP0CG01 181 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 IDH3AP50213 366 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CRISP3P54108 245 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 AQP5P55064 265 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2B6P58173 313 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 RAC3P60763 192 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 STK11Q15831 433 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 LIN52Q52LA3 116 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 EPGNQ6UW88 154 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GRINAQ7Z429 371 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 VRK2Q86Y07 508 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC43A2Q8N370 569 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CADM2Q8N3J6 435 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 S100PBPQ96BU1 408 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 RLIMQ9NVW2 624 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CALML5Q9NZT1 146 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MED13LQ71F56 2210 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA4P78363 2273 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP73A6NFT4 308 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 C5orf58C9J3I9 102 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAM11O75078 769 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 LYZL6O75951 148 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAP00813 363 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 IGHV3-9P01782 118 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 YES1P07947 543 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CD99P14209 185 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NID1P14543 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP3CBP16298 524 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TACR3P29371 465 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PLAURQ03405 335 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CMIPQ8IY22 773 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MAL2Q969L2 176 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 DDIT4LQ96D03 193 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM19Q96HH6 336 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ARL5BQ96KC2 179 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CCL19Q99731 98 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PSD2Q9BQI7 771 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 EMC3Q9P0I2 261 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PRSS50Q9UI38 385 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM72A0PK05 275 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CLIC1O00299 241 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CLOCKO15516 846 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CYTIPO60759 359 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 THBDP07204 575 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GUSBP08236 651 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 CD53P19397 219 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 HTR3AP46098 478 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 COPZ1P61923 177 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 EPS8Q12929 822 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 AGKQ53H12 422 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms