RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	AGA	P20933	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ME2	P23368	584 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	HTR3A	P46098	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PMPCA	Q10713	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RNF148	Q8N7C7	305 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RND1	Q92730	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	WNT2B	Q93097	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	NDE1	Q9NXR1	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ZNF208	O43345	1280 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	IMPDH2	P12268	514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	EGR4	Q05215	589 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	FOXF2	Q12947	444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PON3	Q15166	354 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ADA2	Q9NZK5	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	GJE1	A6NN92	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538		B2RBV5	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ARPC2	O15144	300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TNFSF13	O75888	250 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RCBTB2	O95199	551 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CHRNB4	P30926	498 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	MNAT1	P51948	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TFF3	Q07654	80 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	BNIP2	Q12982	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	MYBPH	Q13203	477 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CARM1	Q86X55	608 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	MCHR1	Q99705	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	BAG5	Q9UL15	447 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PNV4	684 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	CLDN14	O95500	239 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	PMS2P2	O95744	297 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SERPINA1	P01009	418 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	SEMG1	P04279	462 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	FCGR2A	P12318	317 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP22-211	ENST00000584538	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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