RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562425.1

PKD1-226, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-226ENST00000562425 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 RCN3Q96D15 328 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 OR5B2Q96R09 309 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.71□□□□□ -0.05
PKD1-226ENST00000562425 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 A0A1W2PNV4 684 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 C19orf84I3L1E1 186 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SYT5O00445 386 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 AIM2O14862 343 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CXCR1P25024 350 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TACR3P29371 465 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 AQP1P29972 269 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PRDX6P30041 224 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PCGF2P35227 344 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 RAC3P60763 192 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TFF3Q07654 80 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 VMACQ2NL98 169 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CADM2Q8N3J6 435 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 DDIT4LQ96D03 193 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ADAM19Q9H013 955 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.7□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CACNA1CQ13936 2221 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 A0A1W2PNR3 127 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 M0QX08 132 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SULT2B1O00204 365 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 NDUFAB1O14561 156 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ZNF208O43345 1280 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 AQP8O94778 261 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 MFN2O95140 757 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 UQCRC1P31930 480 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CTBP2P56545 445 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 KIF18BQ86Y91 864 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SLC43A2Q8N370 569 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PIF1Q9H611 641 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 JKAMPQ9P055 326 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 HIVEP1P15822 2718 aa14.69□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 DOCK7Q96N67 2140 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 MSTNO14793 375 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TNFSF13O75888 250 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 DCTN3O75935 186 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PRKD3O94806 890 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 C8BP07358 591 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 PRG2P13727 222 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CCNA2P20248 432 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ENPP1P22413 925 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 DIO1P49895 249 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 GZMMP51124 257 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 NCALDP61601 193 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SIRPAP78324 504 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 VEZF1Q14119 521 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 FCRLAQ7L513 359 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TREML1Q86YW5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TRIM2Q9C040 744 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 GP6Q9HCN6 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 AKAP9Q99996 3911 aa14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.67□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 DNPH1O43598 174 aa14.67□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 TPST1O60507 370 aa14.67□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PKD1-226ENST00000562425 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms