RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 SKP2Q13309 424 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ATMQ13315 3056 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 INAQ16352 499 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 DUSP7Q16829 419 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 C16orf89Q6UX73 402 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ASRGL1Q7L266 308 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 IFNEQ86WN2 208 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MICU2Q8IYU8 434 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF843Q8N446 348 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 RNF148Q8N7C7 305 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TEX19Q8NA77 164 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GATSQ8NAP1 163 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 HIPK4Q8NE63 616 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OR2T12Q8NG77 320 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 BBS10Q8TAM1 723 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 Q8TCH9 128 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GPR119Q8TDV5 335 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ARSGQ96EG1 525 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NPAS1Q99742 590 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 DOHHQ9BU89 302 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CALML5Q9NZT1 146 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MED11Q9P086 117 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 AP3M1Q9Y2T2 418 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 BSNQ9UPA5 3926 aa5.95□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CACNA1GO43497 2377 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 A0A1B0GVC2 190 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 FAM166BA8MTA8 275 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 VSTM5A8MXK1 200 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 SCDO00767 359 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ACOT8O14734 319 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF264O43296 627 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 HS6ST1O60243 411 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NTN1O95631 604 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 IGHG3P01860 377 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 LINGO3P0C6S8 592 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PRG2P13727 222 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NCK1P16333 377 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 AQP1P29972 269 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PRKAR1BP31321 381 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MAGEA5P43359 124 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 KCNJ5P48544 419 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF136P52737 540 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MLLT10P55197 1068 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NCALDP61601 193 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GNA13Q14344 377 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 NPTX1Q15818 432 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CYP51A1Q16850 503 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 RNF220Q5VTB9 566 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 ARSKQ6UWY0 536 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CMIPQ8IY22 773 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 POC1BQ8TC44 478 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 FAR1Q8WVX9 515 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 LAT2Q9GZY6 243 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 DSN1Q9H410 356 aa5.94□□□□□ -1.46
APAF1-211ENST00000552268 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms