RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 OR1J4Q8NGS1 313 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 OR10A6Q8NH74 314 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 STARD4Q96DR4 205 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 NSL1Q96IY1 281 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 SPATA9Q9BWV2 254 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 BCL2L10Q9HD36 194 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 PACSIN3Q9UKS6 424 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.36□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 SERINC4A6NH21 518 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 AGAP5A6NIR3 686 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 H0Y3Z8 333 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 KLF4O43474 513 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 PAX1P15863 534 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 UGT2B10P36537 528 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CDK6Q00534 326 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 SCARB2Q14108 478 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 OR5M10Q6IEU7 315 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 REEP3Q6NUK4 255 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 FADS6Q8N9I5 356 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 FBXO27Q8NI29 283 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 NFKBIDQ8NI38 313 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 DUSP19Q8WTR2 217 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-231ENST00000552222 ZNF583Q96ND8 569 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ECSITQ9BQ95 431 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 HHATLQ9HCP6 504 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CMTM6Q9NX76 183 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ZNF226Q9NYT6 803 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CLCF1Q9UBD9 225 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 AP3M1Q9Y2T2 418 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 C5orf58C9J3I9 102 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 H3BNH8 94 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CBR3O75828 277 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CALB2P22676 271 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CD79BP40259 229 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 SLC7A2P52569 658 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 PSME3P61289 254 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 FGFBP1Q14512 234 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 NHSL2Q5HYW2 709 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 GATSQ8NAP1 163 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 HIPK4Q8NE63 616 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 BBS10Q8TAM1 723 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 PIF1Q9H611 641 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 ABCD2Q9UBJ2 740 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 FBXL2Q9UKC9 423 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.34□□□□□ -0.438e-11■■■■■ 34.1
CS-231ENST00000552222 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.33□□□□□ -0.43
CS-231ENST00000552222 CCT8L1PA6NM43 557 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 NME4O00746 187 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 SOD3P08294 240 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 UBL4AP11441 157 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 ETS2P15036 469 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 PTNP21246 168 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 PCGF2P35227 344 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
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CS-231ENST00000552222 VMACQ2NL98 169 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 SLC30A8Q8IWU4 369 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 ZNF614Q8N883 585 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 ZNF610Q8N9Z0 462 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 OR2M3Q8NG83 312 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 KLHL4Q9C0H6 718 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 DSN1Q9H410 356 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-231ENST00000552222 CXorf56Q9H5V9 222 aa12.33□□□□□ -0.44
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