RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFSF12	O43508	249 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CHMP2A	O43633	222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEC1	O60732	1142 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RAMP3	O60896	148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2J3	O76001	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CLPTM1	O96005	669 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPIND1	P05546	499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	BCKDHA	P12694	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MSR1	P21757	451 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MARK3	P27448	753 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GNA11	P29992	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FCGR2C	P31995	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYBB2	P43320	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTO1	P78417	241 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MAB21L1	Q13394	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ILK	Q13418	452 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCP1	Q15431	976 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM189A2	Q15884	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		Q3ZCU0	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00523	Q86TU6	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNMB4	Q86W47	210 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HOGA1	Q86XE5	327 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	BAD	Q92934	168 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CD101	Q93033	1021 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SLITRK2	Q9H156	845 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NT5M	Q9NPB1	228 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SBNO1	A3KN83	1393 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DOCK7	Q96N67	2140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BMQ9	156 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PDLIM1	O00151	329 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RY10	O00398	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FCN1	O00602	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FBP2	O00757	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DLGAP1	O14490	977 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	BCKDK	O14874	412 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TM9SF1	O15321	606 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF749	O43361	778 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AP2A1	O95782	977 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TGM6	O95932	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYGC	P07315	174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IVL	P07476	585 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF24	P17028	368 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SRM	P19623	302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HMOX2	P30519	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKAR2B	P31323	418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD17B2	P37059	387 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DCT	P40126	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RIPK4	P57078	832 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB11A	P62491	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK16	Q00536	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF85	Q03923	595 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KLRB1	Q12918	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CRMP1	Q14194	572 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB11B	Q15907	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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