RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 EPB42P16452 691 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 C4BPBP20851 252 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RFX3P48380 749 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SSTP61278 116 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ILKQ13418 452 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MACC1Q6ZN28 852 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PXT1Q8NFP0 134 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR51M1Q9H341 326 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ADCYAP1P18509 176 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MICBQ29980 383 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR10G6Q8NH81 332 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RNFT2Q96EX2 444 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR1F2PQ96R84 312 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GHRLQ9UBU3 117 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 CKAP5Q14008 2032 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN9O95484 217 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OCLNQ16625 522 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 AMZ1Q400G9 498 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 HES5Q5TA89 166 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GPR156Q8NFN8 814 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ARL5BQ96KC2 179 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF69Q9UC07 566 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TRBC2A0A5B9 178 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS38A1L453 326 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFS1P28331 727 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 IGFALSP35858 605 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SCARB2Q14108 478 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ACER2Q5QJU3 275 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MANEAQ5SRI9 462 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TRIB3Q96RU7 358 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM129A0AVI4 362 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 MGAT4DA6NG13 374 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1C2O00338 296 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ICOSLGO75144 302 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GPR89BP0CG08 455 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PPP3CBP16298 524 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 PRPS1L1P21108 318 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SHC1P29353 583 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TAP2Q03519 686 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 C18orf63Q68DL7 685 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 IQCHQ86VS3 1027 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB2Q8N680 514 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ACRV1P26436 265 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 TRAM2Q15035 370 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 EID2Q8N6I1 236 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 LCN9Q8WX39 176 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-211ENST00000520276 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms