RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517982.1

PTDSS1-204, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-204ENST00000517982 H3BNX3 289 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 OR2T1O43869 369 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SEMA7AO75326 666 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 CCNB2O95067 398 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 PRSS23O95084 383 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 AHSA1O95433 338 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 IGHG3P01860 377 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 CELA3AP09093 270 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 FPR1P21462 350 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 MST1P26927 711 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 NFATC3Q12968 1075 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TAF11Q15544 211 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 BCL2A1Q16548 175 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TRILQ7L0X0 811 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SVOPLQ8N434 492 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 MEIOBQ8N635 442 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 Q8NA96 180 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 PIGXQ8TBF5 258 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 POC1BQ8TC44 478 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SMPDL3BQ92485 455 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SARAFQ96BY9 339 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 NRBF2Q96F24 287 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 GPR137Q96N19 417 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 PKP2Q99959 881 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TAPBPLQ9BX59 468 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.96□□□□□ -0.49
PTDSS1-204ENST00000517982 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 A0A1B0GVC2 190 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM72A0PK05 275 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 OR14I1A6ND48 311 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 G3V2T6 193 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 AQP7O14520 342 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 OR10H3O60404 316 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 HIST1H2ABP04908 130 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ANPEPP15144 967 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF23P17027 643 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SFTPDP35247 375 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 GFRA1P56159 465 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 NUP107P57740 925 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 RBPJQ06330 500 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 RIPK1Q13546 671 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 MICAQ29983 383 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SYT14P1Q58G82 188 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SIAH3Q8IW03 269 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SLC7A13Q8TCU3 470 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 GIPC3Q8TF64 312 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 KLHL15Q96M94 604 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 OR5B2Q96R09 309 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 A0A087WUU8 490 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 BCKDKO14874 412 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 MGRN1O60291 552 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 LYPD3O95274 346 aa11.94□□□□□ -0.5
PTDSS1-204ENST00000517982 THY1P04216 161 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms