RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESR2Q92731 530 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPRTQ96BW1 309 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CITED1Q99966 193 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRPV5Q9NQA5 729 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCL28Q9NRJ3 127 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCYOX1Q9UHG3 505 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 V9GY05 133 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM74A7A6NL05 159 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PP2D1A8MPX8 630 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSF2BPO75031 334 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEDDO75618 318 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDRT1O95170 752 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 HBQ1P09105 142 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CALB2P22676 271 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUMBP49757 651 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT83P78385 493 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYBPC1Q00872 1141 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FTMTQ8N4E7 242 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 STKLD1Q8NE28 680 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNIH3Q8TBE1 160 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A36Q96CQ1 311 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCRL1Q96LA6 429 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAT9Q9BTE0 207 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOCK8Q8NF50 2099 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CARMIL3Q8ND23 1372 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0U1RRA0 63 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASHC1A8K0Z3 465 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MUU9 505 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNA14O95837 355 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLAP06280 429 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00869P0C866 280 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDHBP11177 359 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FMO3P31513 532 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TGFBR1P36897 503 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRISP1P54107 249 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTHL1P78549 312 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAGE3Q14657 143 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 RALBP1Q15311 655 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEK5Q6P3R8 708 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM270Q6UE05 265 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LANCL3Q6ZV70 420 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS41Q7RTY9 318 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FIBINQ8TAL6 211 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 M1APQ8TC57 530 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 VMP1Q96GC9 406 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDXPQ96GD0 296 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF157Q96PX1 679 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SELENOIQ9C0D9 397 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC5A7Q9GZV3 580 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF385DQ9H6B1 395 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC40A1Q9NP59 571 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF320A2RRD8 509 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGPAT2O15120 278 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADCY5O95622 1261 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGI1O95970 557 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGLV2-23P01705 113 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL4P05112 153 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN6P29350 595 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF763Q0D2J5 394 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAMBIQ13145 260 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CUL1Q13616 776 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf71Q6IPW1 123 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST7LQ8TDW4 575 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIAEQ9HAT2 523 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYTH4Q9UIA0 394 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SVILO95425 2214 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3QRE1 110 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFA7O95182 113 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLUP10909 449 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLX1P56177 255 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PITPNAQ00169 270 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF684Q5T5D7 378 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATL3Q6DD88 541 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SASS6Q6UVJ0 657 aa0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms