RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CNIH4	Q9P003	139 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CEACAM4	O75871	244 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DDAH2	O95865	285 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRB1	P04280	392 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	STS	P08842	583 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CCNA2	P20248	432 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PSMB9	P28065	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIC	P45877	212 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC37A1	P57057	533 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OSTF1	Q92882	214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DSN1	Q9H410	356 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV3-11	P04433	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SERPINA7	P05543	415 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC26A5	P58743	744 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	EFNB1	P98172	346 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PSMF1	Q92530	271 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ART5	Q96L15	291 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0B4J2E0	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GX12	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRKY	O43930	277 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	LCK	P06239	509 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR4	P46093	362 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SOX8	P57073	446 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DCAF7	P61962	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRKCD	Q05655	676 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NNAT	Q16517	81 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GWA3	101 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PPW3	197 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FRG2C	A6NGY1	282 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CHP2	O43745	196 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	MAN1A2	O60476	641 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	GABARAP	O95166	117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IL33	O95760	270 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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