RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TFAP2CQ92754 450 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TM9SF2Q99805 663 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MENTQ9BUN1 341 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPR171O14626 319 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0513O60268 411 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GFRA3O60609 400 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 INMTO95050 263 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FGF5P12034 268 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RCVRNP35243 200 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ARTNQ5T4W7 220 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LHPPQ9H008 270 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPR83Q9NYM4 423 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CLCA1A8K7I4 914 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A1O15245 554 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 APOL3O95236 402 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ABCD3P28288 659 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CSF2RBP32927 897 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SDC2P34741 201 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MNDAP41218 407 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CARD18P57730 90 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR12D2P58182 307 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPR85P60893 370 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 USP43Q70EL4 1123 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PITX2Q99697 317 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MED17Q9NVC6 651 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PQM1 296 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 DLGAP3O95886 979 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NR4A1P22736 598 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP24386 653 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MAN2A2P49641 1150 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RNF220Q5VTB9 566 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LILRA2Q8N149 483 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NUBPLQ8TB37 319 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 ADAM8P78325 824 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TRAM1Q15629 374 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SATL1Q86VE3 508 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 SYT14Q8NB59 555 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NEK7Q8TDX7 302 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CBR3O75828 277 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 HPP00738 406 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 STSP08842 583 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CELP19835 753 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ENPP1P22413 925 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PYCR1P32322 319 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD7P51665 324 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 SELENBP1Q13228 472 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CDK5R2Q13319 367 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SPHARQ15513 63 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OR5J2Q8NH18 312 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 M1APQ8TC57 530 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM203Q969S6 136 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.6□□□□□ -1.19
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