RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-216ENST00000475195 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-216ENST00000475195 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-216ENST00000475195 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FXYD1O00168 92 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DNPH1O43598 174 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC22O60826 627 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KRT34O76011 436 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MFN2O95140 757 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PMS2P2O95744 297 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PRG2P13727 222 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ENPP1P22413 925 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TACR3P29371 465 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SLC7A1P30825 629 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KIR2DL3P43628 341 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DIO1P49895 249 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SEC24CP53992 1094 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MTPNP58546 118 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FCRLAQ7L513 359 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KRT73Q86Y46 540 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ARL5BQ96KC2 179 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 OR5B2Q96R09 309 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SH3GL1Q99961 368 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GALNT8Q9NY28 637 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TPST1O60507 370 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SERPINB7O75635 380 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SIRPAP78324 504 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 H3F3AP84243 136 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MMEL1Q495T6 779 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 REP15Q6BDI9 236 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FAM222BQ8WU58 562 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF607Q96SK3 696 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 BCO1Q9HAY6 547 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PROCRQ9UNN8 238 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM72A0PK05 275 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GMNCA6NCL1 334 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 M0QX08 132 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SULT2B1O00204 365 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CYTIPO60759 359 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 YES1P07947 543 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DRD4P21917 467 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 AGTR1P30556 359 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LSP1P33241 339 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CD79BP40259 229 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CTBP2P56545 445 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 COPZ1P61923 177 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TLE4Q04727 773 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FAM27E3Q08E93 113 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MYBPHQ13203 477 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PDK3Q15120 406 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC80Q76M96 950 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA21Q7Z572 469 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SNX32Q86XE0 403 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 OR10A6Q8NH74 314 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ABHD3Q8WU67 409 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DDIT4LQ96D03 193 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PSD2Q9BQI7 771 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF559Q9BR84 538 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ARMCX1Q9P291 453 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MPDZO75970 2070 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MRASO14807 208 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SNX3O60493 162 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms