RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MGAQ8IWI9 3026 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM72A0PK05 275 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MVM7 634 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTL6AO96019 429 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 IGF2P01344 180 aa8.49□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V1G2O95670 118 aa8.48□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 OR6S1Q8NH40 331 aa8.48□□□□□ -1.05
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SH3BP4-208ENST00000462602 FUZQ9BT04 418 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 VNN3Q9NY84 501 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LUZP4Q9P127 313 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.48□□□□□ -1.05
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